Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd80Q00609 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd80Q00609 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd80Q00609 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd80Q00609 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd80Q00609 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd80Q00609 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd80Q00609 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms