Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Taf1bP97358 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Taf1bP97358 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Taf1bP97358 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms