Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Irf3P70671 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irf3P70671 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irf3P70671 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irf3P70671 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Irf3P70671 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irf3P70671 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irf3P70671 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irf3P70671 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Irf3P70671 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irf3P70671 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irf3P70671 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irf3P70671 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irf3P70671 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irf3P70671 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf3P70671 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf3P70671 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irf3P70671 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irf3P70671 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irf3P70671 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irf3P70671 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irf3P70671 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irf3P70671 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irf3P70671 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irf3P70671 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irf3P70671 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irf3P70671 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irf3P70671 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irf3P70671 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irf3P70671 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irf3P70671 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Irf3P70671 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irf3P70671 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irf3P70671 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf3P70671 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf3P70671 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irf3P70671 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irf3P70671 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irf3P70671 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irf3P70671 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irf3P70671 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irf3P70671 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irf3P70671 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Irf3P70671 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf3P70671 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf3P70671 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf3P70671 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf3P70671 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms