Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabra1P62812 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gabra1P62812 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms