Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ActbP60710 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ActbP60710 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ActbP60710 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ActbP60710 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ActbP60710 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ActbP60710 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ActbP60710 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ActbP60710 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ActbP60710 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ActbP60710 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ActbP60710 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ActbP60710 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ActbP60710 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ActbP60710 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ActbP60710 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ActbP60710 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ActbP60710 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ActbP60710 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ActbP60710 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ActbP60710 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ActbP60710 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ActbP60710 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ActbP60710 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ActbP60710 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ActbP60710 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ActbP60710 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ActbP60710 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ActbP60710 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ActbP60710 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ActbP60710 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ActbP60710 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ActbP60710 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ActbP60710 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ActbP60710 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ActbP60710 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ActbP60710 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ActbP60710 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ActbP60710 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ActbP60710 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ActbP60710 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ActbP60710 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ActbP60710 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ActbP60710 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ActbP60710 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ActbP60710 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ActbP60710 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ActbP60710 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ActbP60710 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ActbP60710 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ActbP60710 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ActbP60710 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ActbP60710 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ActbP60710 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ActbP60710 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ActbP60710 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ActbP60710 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ActbP60710 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ActbP60710 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ActbP60710 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ActbP60710 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ActbP60710 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ActbP60710 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ActbP60710 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ActbP60710 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ActbP60710 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ActbP60710 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ActbP60710 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ActbP60710 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ActbP60710 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ActbP60710 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ActbP60710 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ActbP60710 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ActbP60710 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ActbP60710 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ActbP60710 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ActbP60710 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ActbP60710 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ActbP60710 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ActbP60710 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ActbP60710 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ActbP60710 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ActbP60710 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ActbP60710 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ActbP60710 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ActbP60710 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ActbP60710 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ActbP60710 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ActbP60710 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ActbP60710 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ActbP60710 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ActbP60710 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ActbP60710 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ActbP60710 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ActbP60710 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ActbP60710 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ActbP60710 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ActbP60710 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ActbP60710 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ActbP60710 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms