Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcbp1P60335 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcbp1P60335 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pcbp1P60335 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcbp1P60335 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcbp1P60335 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcbp1P60335 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcbp1P60335 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcbp1P60335 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcbp1P60335 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcbp1P60335 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcbp1P60335 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcbp1P60335 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcbp1P60335 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms