Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdsp1P58466 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms