Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snrpa1P57784 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snrpa1P57784 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms