Protein–RNA interactions for Protein: P55849

Dsc1, Desmocollin-1, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc1P55849 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Dsc1P55849 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsc1P55849 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsc1P55849 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsc1P55849 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsc1P55849 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsc1P55849 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsc1P55849 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsc1P55849 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsc1P55849 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsc1P55849 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsc1P55849 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsc1P55849 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsc1P55849 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsc1P55849 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsc1P55849 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsc1P55849 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsc1P55849 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsc1P55849 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsc1P55849 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsc1P55849 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsc1P55849 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsc1P55849 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dsc1P55849 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.8 ms