Protein–RNA interactions for Protein: P51791

Clcn3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn3P51791 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clcn3P51791 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Clcn3P51791 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clcn3P51791 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clcn3P51791 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcn3P51791 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms