Protein–RNA interactions for Protein: P50707

Defa9, Alpha-defensin 9, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa9P50707 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa9P50707 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa9P50707 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa9P50707 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa9P50707 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa9P50707 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa9P50707 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa9P50707 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa9P50707 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa9P50707 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms