Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TspoP50637 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TspoP50637 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TspoP50637 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TspoP50637 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TspoP50637 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TspoP50637 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TspoP50637 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TspoP50637 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TspoP50637 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TspoP50637 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TspoP50637 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TspoP50637 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TspoP50637 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TspoP50637 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TspoP50637 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TspoP50637 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TspoP50637 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TspoP50637 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TspoP50637 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TspoP50637 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TspoP50637 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TspoP50637 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TspoP50637 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TspoP50637 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TspoP50637 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TspoP50637 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TspoP50637 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TspoP50637 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TspoP50637 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TspoP50637 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TspoP50637 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TspoP50637 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TspoP50637 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TspoP50637 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TspoP50637 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TspoP50637 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TspoP50637 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TspoP50637 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TspoP50637 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TspoP50637 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TspoP50637 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TspoP50637 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TspoP50637 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TspoP50637 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TspoP50637 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TspoP50637 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TspoP50637 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TspoP50637 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TspoP50637 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TspoP50637 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TspoP50637 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TspoP50637 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TspoP50637 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TspoP50637 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TspoP50637 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TspoP50637 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TspoP50637 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TspoP50637 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TspoP50637 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TspoP50637 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TspoP50637 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TspoP50637 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TspoP50637 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TspoP50637 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TspoP50637 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TspoP50637 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TspoP50637 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TspoP50637 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TspoP50637 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TspoP50637 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TspoP50637 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TspoP50637 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TspoP50637 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TspoP50637 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TspoP50637 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TspoP50637 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TspoP50637 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TspoP50637 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TspoP50637 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TspoP50637 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TspoP50637 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TspoP50637 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TspoP50637 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TspoP50637 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TspoP50637 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TspoP50637 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TspoP50637 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TspoP50637 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TspoP50637 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TspoP50637 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TspoP50637 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TspoP50637 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TspoP50637 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TspoP50637 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TspoP50637 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TspoP50637 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TspoP50637 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TspoP50637 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TspoP50637 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms