Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VegfbP49766 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VegfbP49766 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VegfbP49766 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VegfbP49766 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VegfbP49766 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VegfbP49766 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VegfbP49766 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VegfbP49766 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VegfbP49766 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VegfbP49766 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VegfbP49766 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VegfbP49766 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VegfbP49766 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VegfbP49766 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VegfbP49766 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VegfbP49766 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VegfbP49766 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VegfbP49766 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VegfbP49766 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VegfbP49766 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VegfbP49766 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VegfbP49766 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VegfbP49766 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VegfbP49766 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VegfbP49766 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VegfbP49766 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VegfbP49766 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VegfbP49766 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VegfbP49766 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VegfbP49766 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VegfbP49766 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VegfbP49766 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VegfbP49766 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VegfbP49766 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VegfbP49766 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VegfbP49766 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VegfbP49766 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VegfbP49766 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VegfbP49766 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VegfbP49766 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VegfbP49766 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VegfbP49766 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VegfbP49766 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VegfbP49766 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VegfbP49766 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VegfbP49766 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VegfbP49766 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VegfbP49766 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
VegfbP49766 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VegfbP49766 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VegfbP49766 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VegfbP49766 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VegfbP49766 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VegfbP49766 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VegfbP49766 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VegfbP49766 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VegfbP49766 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VegfbP49766 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VegfbP49766 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VegfbP49766 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VegfbP49766 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VegfbP49766 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VegfbP49766 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VegfbP49766 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VegfbP49766 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
VegfbP49766 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VegfbP49766 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
VegfbP49766 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VegfbP49766 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VegfbP49766 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VegfbP49766 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VegfbP49766 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VegfbP49766 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VegfbP49766 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VegfbP49766 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VegfbP49766 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms