Protein–RNA interactions for Protein: P49312

Hnrnpa1, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnrnpa1P49312 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hnrnpa1P49312 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hnrnpa1P49312 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hnrnpa1P49312 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hnrnpa1P49312 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hnrnpa1P49312 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hnrnpa1P49312 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hnrnpa1P49312 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.3 ms