Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox8bP48772 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cox8bP48772 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox8bP48772 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.4 ms