Protein–RNA interactions for Protein: P47880

Igfbp6, Insulin-like growth factor-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp6P47880 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Igfbp6P47880 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Igfbp6P47880 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Igfbp6P47880 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Igfbp6P47880 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Igfbp6P47880 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Igfbp6P47880 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Igfbp6P47880 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Igfbp6P47880 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Igfbp6P47880 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Igfbp6P47880 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Igfbp6P47880 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Igfbp6P47880 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Igfbp6P47880 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Igfbp6P47880 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Igfbp6P47880 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Igfbp6P47880 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Igfbp6P47880 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Igfbp6P47880 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Igfbp6P47880 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Igfbp6P47880 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Igfbp6P47880 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Igfbp6P47880 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Igfbp6P47880 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Igfbp6P47880 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Igfbp6P47880 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Igfbp6P47880 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Igfbp6P47880 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Igfbp6P47880 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Igfbp6P47880 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Igfbp6P47880 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Igfbp6P47880 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Igfbp6P47880 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Igfbp6P47880 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Igfbp6P47880 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Igfbp6P47880 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Igfbp6P47880 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Igfbp6P47880 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Igfbp6P47880 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Igfbp6P47880 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Igfbp6P47880 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Igfbp6P47880 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Igfbp6P47880 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Igfbp6P47880 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.3 ms