Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf9P41274 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfsf9P41274 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms