Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf3rP40223 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Csf3rP40223 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csf3rP40223 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Csf3rP40223 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Csf3rP40223 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csf3rP40223 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Csf3rP40223 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csf3rP40223 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csf3rP40223 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csf3rP40223 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Csf3rP40223 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csf3rP40223 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csf3rP40223 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csf3rP40223 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csf3rP40223 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csf3rP40223 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csf3rP40223 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csf3rP40223 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Csf3rP40223 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csf3rP40223 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csf3rP40223 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csf3rP40223 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Csf3rP40223 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Csf3rP40223 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csf3rP40223 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Csf3rP40223 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csf3rP40223 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms