Protein–RNA interactions for Protein: P35846

Folr1, Folate receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Folr1P35846 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Folr1P35846 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Folr1P35846 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Folr1P35846 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Folr1P35846 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Folr1P35846 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Folr1P35846 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Folr1P35846 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Folr1P35846 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Folr1P35846 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Folr1P35846 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Folr1P35846 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Folr1P35846 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Folr1P35846 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Folr1P35846 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Folr1P35846 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Folr1P35846 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Folr1P35846 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Folr1P35846 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Folr1P35846 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Folr1P35846 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Folr1P35846 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Folr1P35846 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Folr1P35846 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Folr1P35846 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Folr1P35846 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Folr1P35846 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Folr1P35846 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Folr1P35846 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Folr1P35846 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Folr1P35846 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Folr1P35846 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Folr1P35846 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Folr1P35846 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Folr1P35846 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Folr1P35846 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Folr1P35846 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Folr1P35846 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Folr1P35846 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Folr1P35846 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Folr1P35846 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Folr1P35846 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Folr1P35846 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Folr1P35846 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Folr1P35846 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Folr1P35846 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Folr1P35846 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Folr1P35846 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Folr1P35846 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Folr1P35846 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Folr1P35846 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Folr1P35846 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Folr1P35846 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Folr1P35846 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Folr1P35846 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Folr1P35846 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Folr1P35846 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Folr1P35846 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Folr1P35846 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Folr1P35846 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Folr1P35846 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Folr1P35846 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Folr1P35846 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Folr1P35846 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Folr1P35846 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Folr1P35846 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Folr1P35846 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Folr1P35846 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Folr1P35846 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Folr1P35846 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Folr1P35846 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Folr1P35846 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Folr1P35846 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Folr1P35846 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Folr1P35846 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms