Protein–RNA interactions for Protein: P30416

Fkbp4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fkbp4P30416 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fkbp4P30416 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fkbp4P30416 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fkbp4P30416 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fkbp4P30416 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fkbp4P30416 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fkbp4P30416 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fkbp4P30416 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fkbp4P30416 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fkbp4P30416 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fkbp4P30416 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fkbp4P30416 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fkbp4P30416 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fkbp4P30416 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fkbp4P30416 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fkbp4P30416 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fkbp4P30416 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fkbp4P30416 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fkbp4P30416 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fkbp4P30416 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fkbp4P30416 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fkbp4P30416 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fkbp4P30416 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fkbp4P30416 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fkbp4P30416 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fkbp4P30416 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fkbp4P30416 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fkbp4P30416 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.7 ms