Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RxraP28700 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RxraP28700 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RxraP28700 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RxraP28700 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RxraP28700 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RxraP28700 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RxraP28700 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RxraP28700 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RxraP28700 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RxraP28700 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RxraP28700 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RxraP28700 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RxraP28700 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RxraP28700 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RxraP28700 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RxraP28700 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RxraP28700 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RxraP28700 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RxraP28700 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RxraP28700 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RxraP28700 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RxraP28700 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RxraP28700 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RxraP28700 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RxraP28700 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RxraP28700 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RxraP28700 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RxraP28700 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RxraP28700 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RxraP28700 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RxraP28700 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RxraP28700 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RxraP28700 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RxraP28700 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RxraP28700 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RxraP28700 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RxraP28700 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RxraP28700 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RxraP28700 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RxraP28700 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RxraP28700 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RxraP28700 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RxraP28700 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RxraP28700 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RxraP28700 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RxraP28700 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RxraP28700 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RxraP28700 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RxraP28700 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RxraP28700 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RxraP28700 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RxraP28700 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RxraP28700 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RxraP28700 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RxraP28700 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RxraP28700 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RxraP28700 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RxraP28700 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RxraP28700 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RxraP28700 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RxraP28700 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RxraP28700 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RxraP28700 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RxraP28700 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RxraP28700 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RxraP28700 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RxraP28700 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RxraP28700 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RxraP28700 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RxraP28700 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RxraP28700 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RxraP28700 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RxraP28700 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RxraP28700 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RxraP28700 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RxraP28700 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RxraP28700 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RxraP28700 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RxraP28700 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RxraP28700 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RxraP28700 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RxraP28700 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RxraP28700 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RxraP28700 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RxraP28700 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RxraP28700 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RxraP28700 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RxraP28700 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RxraP28700 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RxraP28700 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RxraP28700 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RxraP28700 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RxraP28700 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RxraP28700 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RxraP28700 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RxraP28700 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RxraP28700 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RxraP28700 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RxraP28700 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms