Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nfkb1P25799 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nfkb1P25799 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nfkb1P25799 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfkb1P25799 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms