Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pax3P24610 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pax3P24610 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pax3P24610 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pax3P24610 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pax3P24610 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pax3P24610 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pax3P24610 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pax3P24610 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pax3P24610 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pax3P24610 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pax3P24610 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pax3P24610 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms