Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkchP23298 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkchP23298 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkchP23298 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkchP23298 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkchP23298 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkchP23298 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkchP23298 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkchP23298 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkchP23298 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkchP23298 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkchP23298 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkchP23298 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkchP23298 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkchP23298 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PrkchP23298 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.9 ms