Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PdgfaP20033 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfaP20033 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PdgfaP20033 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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