Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkceP16054 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkceP16054 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkceP16054 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkceP16054 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkceP16054 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkceP16054 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkceP16054 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkceP16054 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkceP16054 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkceP16054 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkceP16054 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkceP16054 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkceP16054 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkceP16054 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkceP16054 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkceP16054 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrkceP16054 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrkceP16054 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrkceP16054 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkceP16054 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrkceP16054 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkceP16054 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PrkceP16054 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrkceP16054 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrkceP16054 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrkceP16054 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkceP16054 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkceP16054 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkceP16054 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkceP16054 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkceP16054 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkceP16054 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkceP16054 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkceP16054 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkceP16054 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrkceP16054 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrkceP16054 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkceP16054 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkceP16054 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkceP16054 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkceP16054 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkceP16054 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkceP16054 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkceP16054 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms