Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp53P15975 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp53P15975 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp53P15975 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp53P15975 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp53P15975 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp53P15975 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp53P15975 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp53P15975 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp53P15975 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp53P15975 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp53P15975 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp53P15975 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp53P15975 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp53P15975 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Usp53P15975 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp53P15975 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp53P15975 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp53P15975 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp53P15975 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp53P15975 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp53P15975 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp53P15975 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp53P15975 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp53P15975 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp53P15975 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp53P15975 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp53P15975 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp53P15975 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp53P15975 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp53P15975 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp53P15975 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp53P15975 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp53P15975 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp53P15975 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp53P15975 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp53P15975 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp53P15975 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp53P15975 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp53P15975 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp53P15975 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp53P15975 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp53P15975 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp53P15975 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp53P15975 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp53P15975 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp53P15975 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp53P15975 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp53P15975 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp53P15975 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp53P15975 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp53P15975 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp53P15975 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp53P15975 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp53P15975 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp53P15975 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp53P15975 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp53P15975 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp53P15975 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp53P15975 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp53P15975 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp53P15975 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp53P15975 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp53P15975 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp53P15975 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp53P15975 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp53P15975 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp53P15975 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp53P15975 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp53P15975 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp53P15975 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp53P15975 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp53P15975 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp53P15975 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp53P15975 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp53P15975 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp53P15975 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp53P15975 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp53P15975 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp53P15975 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp53P15975 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp53P15975 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp53P15975 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp53P15975 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp53P15975 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp53P15975 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms