Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CatspereP0DP43 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CatspereP0DP43 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CatspereP0DP43 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CatspereP0DP43 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms