Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms