Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema3fO88632 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema3fO88632 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema3fO88632 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sema3fO88632 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sema3fO88632 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sema3fO88632 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema3fO88632 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema3fO88632 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema3fO88632 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sema3fO88632 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sema3fO88632 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Sema3fO88632 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sema3fO88632 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema3fO88632 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema3fO88632 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema3fO88632 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema3fO88632 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema3fO88632 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sema3fO88632 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sema3fO88632 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sema3fO88632 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms