Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Xirp1O70373 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms