Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itgb5O70309 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itgb5O70309 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itgb5O70309 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Itgb5O70309 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itgb5O70309 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itgb5O70309 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itgb5O70309 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itgb5O70309 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itgb5O70309 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Itgb5O70309 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itgb5O70309 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itgb5O70309 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itgb5O70309 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itgb5O70309 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itgb5O70309 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Itgb5O70309 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itgb5O70309 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itgb5O70309 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itgb5O70309 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itgb5O70309 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itgb5O70309 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb5O70309 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb5O70309 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itgb5O70309 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itgb5O70309 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itgb5O70309 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itgb5O70309 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itgb5O70309 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itgb5O70309 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb5O70309 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itgb5O70309 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb5O70309 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms