Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Bnip3O55003 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Bnip3O55003 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Bnip3O55003 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Bnip3O55003 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Bnip3O55003 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bnip3O55003 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bnip3O55003 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bnip3O55003 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bnip3O55003 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bnip3O55003 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bnip3O55003 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bnip3O55003 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bnip3O55003 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bnip3O55003 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Bnip3O55003 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Bnip3O55003 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Bnip3O55003 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Bnip3O55003 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Bnip3O55003 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Bnip3O55003 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Bnip3O55003 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Bnip3O55003 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Bnip3O55003 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Bnip3O55003 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Bnip3O55003 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Bnip3O55003 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Bnip3O55003 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Bnip3O55003 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Bnip3O55003 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Bnip3O55003 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Bnip3O55003 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Bnip3O55003 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bnip3O55003 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Bnip3O55003 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Bnip3O55003 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Bnip3O55003 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bnip3O55003 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bnip3O55003 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bnip3O55003 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bnip3O55003 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bnip3O55003 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bnip3O55003 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Bnip3O55003 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms