Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LatO54957 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LatO54957 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LatO54957 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LatO54957 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LatO54957 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LatO54957 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LatO54957 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LatO54957 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LatO54957 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LatO54957 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LatO54957 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LatO54957 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LatO54957 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LatO54957 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LatO54957 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LatO54957 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LatO54957 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LatO54957 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LatO54957 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LatO54957 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LatO54957 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LatO54957 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LatO54957 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LatO54957 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LatO54957 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LatO54957 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LatO54957 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LatO54957 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LatO54957 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LatO54957 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LatO54957 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LatO54957 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LatO54957 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LatO54957 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LatO54957 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LatO54957 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LatO54957 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LatO54957 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LatO54957 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LatO54957 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LatO54957 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LatO54957 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LatO54957 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LatO54957 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LatO54957 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LatO54957 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LatO54957 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LatO54957 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LatO54957 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LatO54957 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LatO54957 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LatO54957 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LatO54957 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LatO54957 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LatO54957 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LatO54957 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LatO54957 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LatO54957 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LatO54957 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LatO54957 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LatO54957 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LatO54957 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LatO54957 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LatO54957 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LatO54957 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LatO54957 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LatO54957 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LatO54957 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LatO54957 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LatO54957 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LatO54957 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LatO54957 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LatO54957 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LatO54957 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LatO54957 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LatO54957 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LatO54957 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LatO54957 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LatO54957 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LatO54957 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LatO54957 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LatO54957 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LatO54957 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LatO54957 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LatO54957 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LatO54957 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LatO54957 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LatO54957 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LatO54957 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LatO54957 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LatO54957 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LatO54957 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LatO54957 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LatO54957 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LatO54957 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LatO54957 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LatO54957 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LatO54957 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LatO54957 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms