Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dnajb6O54946 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dnajb6O54946 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnajb6O54946 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnajb6O54946 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnajb6O54946 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnajb6O54946 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnajb6O54946 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnajb6O54946 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnajb6O54946 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnajb6O54946 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnajb6O54946 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnajb6O54946 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnajb6O54946 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnajb6O54946 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnajb6O54946 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnajb6O54946 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnajb6O54946 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnajb6O54946 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnajb6O54946 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnajb6O54946 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnajb6O54946 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnajb6O54946 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dnajb6O54946 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnajb6O54946 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms