Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2f6O54917 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2f6O54917 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f6O54917 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f6O54917 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f6O54917 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f6O54917 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f6O54917 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f6O54917 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2f6O54917 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2f6O54917 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2f6O54917 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f6O54917 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f6O54917 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f6O54917 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f6O54917 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f6O54917 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f6O54917 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f6O54917 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f6O54917 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f6O54917 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f6O54917 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f6O54917 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f6O54917 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f6O54917 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f6O54917 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f6O54917 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f6O54917 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f6O54917 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f6O54917 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f6O54917 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
E2f6O54917 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f6O54917 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f6O54917 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f6O54917 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f6O54917 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f6O54917 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f6O54917 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f6O54917 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f6O54917 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f6O54917 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms