Protein–RNA interactions for Protein: O54792

Hes2, Transcription factor HES-2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes2O54792 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hes2O54792 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hes2O54792 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hes2O54792 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hes2O54792 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hes2O54792 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hes2O54792 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hes2O54792 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hes2O54792 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hes2O54792 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hes2O54792 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hes2O54792 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hes2O54792 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hes2O54792 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hes2O54792 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hes2O54792 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hes2O54792 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hes2O54792 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hes2O54792 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hes2O54792 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hes2O54792 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hes2O54792 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hes2O54792 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hes2O54792 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hes2O54792 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hes2O54792 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Hes2O54792 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hes2O54792 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hes2O54792 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hes2O54792 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hes2O54792 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hes2O54792 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hes2O54792 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hes2O54792 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hes2O54792 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hes2O54792 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hes2O54792 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hes2O54792 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hes2O54792 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms