Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Pkd2O35245 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Pkd2O35245 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Pkd2O35245 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Pkd2O35245 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC32,32■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC32,29■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC32,29■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC32,28■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,27■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Pkd2O35245 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32,26■■■□□ 2,75
Pkd2O35245 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Pkd2O35245 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Pkd2O35245 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Pkd2O35245 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Pkd2O35245 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Pkd2O35245 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Pkd2O35245 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC32,24■■■□□ 2,75
Pkd2O35245 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC32,24■■■□□ 2,75
Pkd2O35245 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Pkd2O35245 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC32,23■■■□□ 2,75
Pkd2O35245 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Pkd2O35245 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,23■■■□□ 2,75
Pkd2O35245 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Pkd2O35245 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Pkd2O35245 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Pkd2O35245 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC32,21■■■□□ 2,75
Pkd2O35245 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,2■■■□□ 2,75
Pkd2O35245 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC32,2■■■□□ 2,75
Pkd2O35245 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Pkd2O35245 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32,2■■■□□ 2,74
Pkd2O35245 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32,19■■■□□ 2,74
Pkd2O35245 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Pkd2O35245 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Pkd2O35245 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Pkd2O35245 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Pkd2O35245 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC32,16■■■□□ 2,74
Pkd2O35245 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Pkd2O35245 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32,15■■■□□ 2,74
Pkd2O35245 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Pkd2O35245 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC32,15■■■□□ 2,74
Pkd2O35245 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Pkd2O35245 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Pkd2O35245 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32,15■■■□□ 2,74
Pkd2O35245 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Pkd2O35245 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Pkd2O35245 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,15■■■□□ 2,74
Pkd2O35245 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32,14■■■□□ 2,74
Pkd2O35245 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Pkd2O35245 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,13■■■□□ 2,73
Pkd2O35245 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,12■■■□□ 2,73
Pkd2O35245 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Pkd2O35245 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Pkd2O35245 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Pkd2O35245 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Pkd2O35245 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Pkd2O35245 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Pkd2O35245 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,09■■■□□ 2,73
Pkd2O35245 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Pkd2O35245 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Pkd2O35245 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Pkd2O35245 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Pkd2O35245 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Pkd2O35245 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Pkd2O35245 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Pkd2O35245 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Pkd2O35245 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Pkd2O35245 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Pkd2O35245 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Pkd2O35245 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Pkd2O35245 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Pkd2O35245 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Pkd2O35245 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Pkd2O35245 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Pkd2O35245 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Pkd2O35245 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Pkd2O35245 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Pkd2O35245 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC32,04■■■□□ 2,72
Pkd2O35245 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC32,04■■■□□ 2,72
Pkd2O35245 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Pkd2O35245 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Pkd2O35245 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,2 ms