Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcm2O09102 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcm2O09102 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcm2O09102 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcm2O09102 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcm2O09102 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcm2O09102 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcm2O09102 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcm2O09102 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gcm2O09102 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcm2O09102 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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