Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Snap23O09044 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Snap23O09044 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Snap23O09044 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Snap23O09044 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Snap23O09044 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Snap23O09044 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Snap23O09044 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Snap23O09044 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Snap23O09044 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Snap23O09044 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Snap23O09044 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Snap23O09044 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Snap23O09044 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Snap23O09044 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Snap23O09044 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Snap23O09044 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Snap23O09044 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Snap23O09044 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Snap23O09044 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Snap23O09044 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Snap23O09044 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Snap23O09044 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Snap23O09044 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Snap23O09044 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Snap23O09044 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Snap23O09044 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Snap23O09044 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Snap23O09044 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Snap23O09044 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Snap23O09044 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Snap23O09044 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Snap23O09044 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Snap23O09044 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Snap23O09044 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Snap23O09044 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Snap23O09044 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Snap23O09044 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Snap23O09044 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Snap23O09044 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Snap23O09044 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Snap23O09044 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Snap23O09044 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Snap23O09044 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Snap23O09044 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Snap23O09044 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Snap23O09044 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Snap23O09044 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Snap23O09044 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Snap23O09044 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Snap23O09044 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Snap23O09044 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Snap23O09044 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Snap23O09044 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Snap23O09044 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Snap23O09044 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Snap23O09044 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Snap23O09044 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Snap23O09044 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Snap23O09044 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Snap23O09044 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Snap23O09044 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Snap23O09044 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Snap23O09044 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Snap23O09044 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Snap23O09044 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Snap23O09044 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Snap23O09044 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Snap23O09044 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Snap23O09044 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Snap23O09044 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Snap23O09044 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Snap23O09044 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Snap23O09044 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Snap23O09044 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms