Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gfra2O08842 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gfra2O08842 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gfra2O08842 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gfra2O08842 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gfra2O08842 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gfra2O08842 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gfra2O08842 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gfra2O08842 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gfra2O08842 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gfra2O08842 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gfra2O08842 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gfra2O08842 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gfra2O08842 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gfra2O08842 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gfra2O08842 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gfra2O08842 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gfra2O08842 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gfra2O08842 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms