Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm20878L7N244 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20878L7N244 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20878L7N244 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20878L7N244 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20878L7N244 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms