Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20877J3QPZ4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20877J3QPZ4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20877J3QPZ4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20877J3QPZ4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20877J3QPZ4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20877J3QPZ4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20877J3QPZ4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20877J3QPZ4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20877J3QPZ4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20877J3QPZ4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20877J3QPZ4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20877J3QPZ4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20877J3QPZ4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20877J3QPZ4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20877J3QPZ4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20877J3QPZ4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20877J3QPZ4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20877J3QPZ4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20877J3QPZ4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20877J3QPZ4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20877J3QPZ4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20877J3QPZ4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20877J3QPZ4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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