Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20825J3QM67 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20825J3QM67 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20825J3QM67 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20825J3QM67 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20825J3QM67 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20825J3QM67 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20825J3QM67 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20825J3QM67 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm20825J3QM67 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20825J3QM67 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20825J3QM67 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm20825J3QM67 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20825J3QM67 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20825J3QM67 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20825J3QM67 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20825J3QM67 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20825J3QM67 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20825J3QM67 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20825J3QM67 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20825J3QM67 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20825J3QM67 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20825J3QM67 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20825J3QM67 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20825J3QM67 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20825J3QM67 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20825J3QM67 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20825J3QM67 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20825J3QM67 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20825J3QM67 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20825J3QM67 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20825J3QM67 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms