Protein–RNA interactions for Protein: G3UW31

Vmn1r176, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r176G3UW31 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r176G3UW31 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r176G3UW31 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r176G3UW31 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms