Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XntrpcF8VQM8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XntrpcF8VQM8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XntrpcF8VQM8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XntrpcF8VQM8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XntrpcF8VQM8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XntrpcF8VQM8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
XntrpcF8VQM8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XntrpcF8VQM8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XntrpcF8VQM8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XntrpcF8VQM8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XntrpcF8VQM8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XntrpcF8VQM8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XntrpcF8VQM8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XntrpcF8VQM8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XntrpcF8VQM8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XntrpcF8VQM8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XntrpcF8VQM8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XntrpcF8VQM8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XntrpcF8VQM8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XntrpcF8VQM8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XntrpcF8VQM8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms