Protein–RNA interactions for Protein: F7CD45

Gm8334, Predicted gene 8334, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8334F7CD45 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm8334F7CD45 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm8334F7CD45 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm8334F7CD45 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm8334F7CD45 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm8334F7CD45 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm8334F7CD45 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8334F7CD45 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8334F7CD45 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8334F7CD45 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8334F7CD45 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8334F7CD45 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8334F7CD45 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8334F7CD45 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8334F7CD45 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8334F7CD45 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8334F7CD45 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8334F7CD45 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8334F7CD45 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8334F7CD45 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8334F7CD45 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8334F7CD45 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8334F7CD45 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8334F7CD45 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8334F7CD45 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8334F7CD45 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8334F7CD45 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8334F7CD45 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm8334F7CD45 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm8334F7CD45 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm8334F7CD45 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm8334F7CD45 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm8334F7CD45 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8334F7CD45 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8334F7CD45 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms