Protein–RNA interactions for Protein: E9Q649

Gcnt4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt4E9Q649 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcnt4E9Q649 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcnt4E9Q649 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Gcnt4E9Q649 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gcnt4E9Q649 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gcnt4E9Q649 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gcnt4E9Q649 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gcnt4E9Q649 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gcnt4E9Q649 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gcnt4E9Q649 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gcnt4E9Q649 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gcnt4E9Q649 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gcnt4E9Q649 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gcnt4E9Q649 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms