Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Chd2E9PZM4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Chd2E9PZM4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Chd2E9PZM4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Chd2E9PZM4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Chd2E9PZM4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Chd2E9PZM4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Chd2E9PZM4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Chd2E9PZM4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Chd2E9PZM4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Chd2E9PZM4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Chd2E9PZM4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Chd2E9PZM4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Chd2E9PZM4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Chd2E9PZM4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Chd2E9PZM4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Chd2E9PZM4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Chd2E9PZM4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Chd2E9PZM4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Chd2E9PZM4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Chd2E9PZM4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Chd2E9PZM4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Chd2E9PZM4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Chd2E9PZM4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Chd2E9PZM4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Chd2E9PZM4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Chd2E9PZM4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Chd2E9PZM4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Chd2E9PZM4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Chd2E9PZM4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Chd2E9PZM4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Chd2E9PZM4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Chd2E9PZM4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Chd2E9PZM4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Chd2E9PZM4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Chd2E9PZM4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Chd2E9PZM4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Chd2E9PZM4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Chd2E9PZM4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Chd2E9PZM4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Chd2E9PZM4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Chd2E9PZM4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Chd2E9PZM4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Chd2E9PZM4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Chd2E9PZM4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Chd2E9PZM4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Chd2E9PZM4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Chd2E9PZM4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Chd2E9PZM4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Chd2E9PZM4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Chd2E9PZM4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Chd2E9PZM4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Chd2E9PZM4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Chd2E9PZM4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Chd2E9PZM4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Chd2E9PZM4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Chd2E9PZM4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Chd2E9PZM4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Chd2E9PZM4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Chd2E9PZM4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Chd2E9PZM4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Chd2E9PZM4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Chd2E9PZM4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Chd2E9PZM4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Chd2E9PZM4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Chd2E9PZM4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Chd2E9PZM4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Chd2E9PZM4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Chd2E9PZM4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Chd2E9PZM4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Chd2E9PZM4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Chd2E9PZM4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Chd2E9PZM4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Chd2E9PZM4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Chd2E9PZM4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Chd2E9PZM4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Chd2E9PZM4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Chd2E9PZM4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Chd2E9PZM4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Chd2E9PZM4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Chd2E9PZM4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC31.89■■■□□ 2.69
Chd2E9PZM4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Chd2E9PZM4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Chd2E9PZM4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Chd2E9PZM4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Chd2E9PZM4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Chd2E9PZM4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Chd2E9PZM4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Chd2E9PZM4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Chd2E9PZM4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Chd2E9PZM4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Chd2E9PZM4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Chd2E9PZM4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Chd2E9PZM4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Chd2E9PZM4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Chd2E9PZM4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Chd2E9PZM4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Chd2E9PZM4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Chd2E9PZM4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Chd2E9PZM4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms