Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FgaE9PV24 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FgaE9PV24 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FgaE9PV24 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms